Гамиланская нация стоит на пороге полного исчезновения: их родной мир неумолимо разрушается, и любая задержка с переселением грозит необратимыми последствиями. Абердт Деслер, понимая, что время на исходе, решается на рискованный шаг — он изображает покорность перед деспотичным правительством планеты Галман, чьи жители почти неотличимы от его собственного народа. За этим спектаклем скрывается дерзкий план: завладеть контролем над Галманом и использовать его ресурсы для экстренной эвакуации гамиланцев. Но едва спасительная операция набирает обороты, на горизонте проявляется неведомая угроза, способная стереть целые миры. Её мощь обрушивается на Искандар — планету-близнец, родной дом королевы Старши, оставляя от неё лишь искажённое, непригодное для жизни пространство.

Пока гамиланцы борются за существование, Земля переживает эпоху мира в лучах славы легендарного линкора «Ямато». Ветераны готовы уступить место новому поколению: на борт прибывают свежие кадеты, а в подмогу флагману отправляются два новых корабля поддержки под началом Юки Мори и Сиро Санады. Однако не все спокойно воспринимают недавние решения капитана Сусуму Кодая — тень сомнений ложится на его авторитет. В ходе шестимесячной учебной экспедиции, совмещённой с дипломатической миссией у гамиланцев, экипаж внезапно узнаёт о масштабной катастрофе, постигшей Искандар. Несмотря на строгие приказы и риски, Кодай принимает судьбоносное решение: он направляет флот к разорённой планете, чтобы вырвать из лап неизвестного врага тех, кто ещё уцелел.